Pada babak kedua pertandingan, terjadi pergantian pemain yang dilakukan oleh timnas Indonesia untuk mencoba membalikkan situasi. Nova Arianto menggantikan Zahaby Gholy dan Rafi Rasyiq menggantikan Mochamad Mierza Fijatullah. Meskipun demikian, Korea Selatan masih tetap mendominasi permainan dan sulit bagi Indonesia untuk menciptakan peluang yang signifikan.
Jin Geon-young dari Korea Selatan mencoba peruntungannya dengan tendangan jarak jauh yang berujung pada sepak pojok. Umpan silang dari Kim Ji-sung juga mengancam karena mengenai mistar, tetapi sundulan Jang Woo-sik tidak menemui sasaran yang tepat. Tekanan terus-menerus membuat fisik pemain Indonesia terkuras, bahkan ada yang terkapar akibat kram saat laga menyisakan 10 menit.
Dalam situasi yang sulit, Indonesia akhirnya mendapat hadiah penalti setelah bola mengenai tangan pemain dari Korea Selatan. Evandra Florasta bertindak sebagai algojo dan meskipun tembakannya berhasil dimentahkan oleh kiper Park Do-hun, dia berhasil memanfaatkan bola muntah untuk membawa Indonesia unggul di menit ke-90+2.
Di masa injury time, timnas Indonesia memasukkan dua bek, Dafa Zaidan dan Putu Ekayana, untuk memperkuat pertahanan. Kehadiran keduanya membantu tim untuk mempertahankan keunggulan dan akhirnya meraih kemenangan.